Наиболее крупными были Астраханское (1705–1706 гг.), Башкирское (1705–1711 гг.) и Булавинское (1707–1708 гг.) восстания. В Астрахани восстали горожане и гарнизон. Царские войска подавили восстание, взяв после непродолжительной осады Астрахань. Одновременно с Астраханским восстанием в 1705 г. на борьбу с правительством поднялись башкиры. В 1711 г. восстание было подавлено. С началом Северной войны и ростом налогов бегство крепостных крестьян на Дон, Яик и в Запорожье значительно возросло и там, особенно на Верхнем Дону, скопилось много новопришлой бедноты. В 1707 г. она восстала под предводительством К. Булавина. Восстание охватило территорию Войска Донского и ближайшие великороссийские уезды, однако, зажиточные казаки не поддержали восставших. В июле 1708 г. Булавин был ими убит в Черкасске, а правительственные войска к январю 1709 г. подавили разрозненные отряды восставших.
Восстание яицких казаков под предводительством Е.И. Пугачёва в 1773–1774 гг. развернулось в крестьянскую войну.
17 сентября 1773 г. Пугачев с небольшим отрядом казаков двинулся на Оренбург и осадил его. К нему примкнули беглые крестьяне, горнозаводские рабочие Южного Урала, башкиры, татары, марийцы и калмыки. Направленный против восставших отряд генерала Кара 9 ноября 1773 г. был разбит, но правительственные войска одержали победы в марте 1774 г. под Татищевой и под Уфой и заставили снять осаду Оренбурга. Пугачёв ушел на Урал, пополнил войско и двинулся на Казань. Он взял ее 12 июля, но был разбит подошедшим отрядом генерала И.И. Михельсона и перешел на правый берег Волги. Там немедленно вспыхнуло крестьянское восстание. У Курмыша Пугачёв встретил правительственные войска и повернул на юг, решив поднять Дон. 24 августа Михельсон нанес восставшим решающее поражение. Пугачёв бежал за Волгу, был схвачен богатыми казаками, 14 сентября выдан правительству и 10 января 1775 г. казнен в Москве. В течение 1775 г. отдельные очаги восстания были постепенно подавлены.